Как сообщается на сайт новосибирского УФАС, летом 2011 года ФАС России признала ОАО «РЖД» нарушившим антимонопольное законодательство в части необоснованного прекращения оказания услуг и создания дискриминационных условий в отношении отдельных грузоотправителей (пункт 4 части 1 статьи 10 Федерального закона «О защите конкуренции»).

В ходе рассмотрения дела комиссия ФАС России установила, что 23 августа 2010 года Западно-Сибирский филиал ОАО «РЖД» дал телеграмму о введении запрета на подачу и погрузку в полувагоны инвентарного парка любой другой номенклатуры груза, кроме угля для нужд ЖКХ и в адрес энергетических предприятий.

На основании телеграммы Западно-Сибирский филиал ОАО «РЖД» в августе и сентябре 2010 года не предоставил ЗАО «ЭПМ-НовЭЗ» полувагоны в полном объеме.
Во избежание срыва поставок, в т.ч. по экспортным контрактам, ЗАО «ЭПМ-НовЭЗ» было вынуждено в экстренном порядке находить вагоны у третьих лиц и переоформлять заявки на перевозку.

По мнению ЗАО «ЭПМ-НовЭЗ», действия ОАО «РЖД» ставят его в неравное положение с другими грузоотправителями и существенно ущемляют его интересы. Это приводит к нарушению обязательств по договорам поставки и заставляет компанию использовать вагоны третьих лиц, что сопряжено с дополнительными временными и денежными расходами.
По результатам рассмотрения дела ФАС России признала Западно-Сибирский филиал ОАО «РЖД» нарушившим ФЗ «О защите конкуренции» и выдала компании предписание. Также в соответствии со статьей 14.31 Кодекса об административных правонарушениях ФАС России оштрафовал компанию на сумму в размере 82 млн. рублей. Западно-Сибирский филиал ОАО «РЖД» оспорил решение и вынесенные штрафные санкции антимонопольной службы в судебных инстанциях.

31 мая 2012 года федеральный арбитражный суд Московского округа оставил в силе решение ФАС России в отношении железнодорожной компании. 5 июня 2012 года Арбитражный суд г. Москвы признал штраф в размере 82 млн рублей в отношении Западно-Сибирского филиала ОАО «РЖД» законным.