Уголовное дело в отношении вице-губернатора было возбуждено в 2006 году. Его обвиняли в нецелевом использовании 36 миллионов рублей из бюджета и растрате. В суде прокурор требовал приговорить Гергерта к пяти годам колонии общего режима, однако 12 декабря 2011 года суд оправдал его по всем пунктам обвинения.

"Прокурор области принес извинения лично от имени государства. Он взял на себя эту обязанность", - сказал Шишебаров, отметив, что письмо с официальными извинениями прокурора было направлено Гергерту по почте.

Адвокат напомнил, что прокурор принес извинения только после того, как защита бывшего вице-губернатора потребовала сделать это и в начале сентября направила в прокуратуру соответствующую жалобу.

"Закон предписывает в подобных случаях принести извинения от имени государства, однако прокуратура, и с я этим уже неоднократно сталкивался, всегда забывает об этом", - сказал собеседник агентства.

Он отметил, что с получением извинений от прокуратуры процесс реабилитации бывшего вице-губернатора, необоснованно обвиненного в должностных преступлениях, можно считать завершенным.
Ранее Гергерт через суд добился, чтобы ему выплатили компенсацию морального вреда в размере в 300 тысяч рублей. В иске он требовал выплаты 10 миллионов рублей. Суд также обязал государство компенсировать расходы на услуги адвокатов, которые понес Гергерт.

По словам бывшего вице-губернатора, он "пять лет ложился и вставал" с клеймом обвиняемого. В суде, когда рассматривался иск о компенсации морального вреда, Гергерт заявил, что хотел показать, "с каким садизмом и с какой безнравственностью это делалось (его уголовное преследование)".
Его адвокат ранее отмечал, что из-за необоснованного привлечения к уголовной ответственности пострадала деловая репутация Гергерта, который после суда подал в отставку с поста вице-губернатора.

Защитник отмечал, что к этому делу было приковано большое внимание, оно широко обсуждалось в СМИ, "и далеко не положительные отзывы и комментарии были". Все это не прошло бесследно, считает адвокат. По его словам, с 1930-х годов человек "такого должностного уровня" впервые был привлечен к уголовному преследованию в Новосибирской области.
Гергерт также ранее отмечал в суде, что возмущен тем, что Следственный комитет РФ по-прежнему размещает на своем сайте информацию об уголовном деле против него и не публикует новую информацию о том, что обвинения были ошибочны и он оправдан.

При оглашении приговора 12 декабря прошлого года судья Григорий Бракар сказал, что вице-губернатор Гергерт "подлежит оправданию ввиду отсутствия в его действиях состава преступления". Суд установил, что бюджетные деньги использовались по назначению - вице-губернатор выделил их в рамках господдержки сектора АПК для компенсации части затрат на покупку комбайнов для уборки хлеба местными сельхозпроизводителями. Судья также обратил внимание, что следователи не учли действующие в регионе местные законы.

После вынесения оправдательного приговора в отставку ушел глава следственного управления СК РФ по области Игорь Телегин. Официально о причинах отставки не сообщалось.
Гергерт сейчас работает в Сибирском отделении Российской академии сельскохозяйственных наук, где он стал заместителем председателя президиума отделения.